細胞STR鑒定，常見問題答疑

1. 報告結果中提示的多等位基因結果是什么？

答：正常的人源細胞組織細胞其STR圖譜，一個基因位點僅出現一個或2個峰。如發生細胞交叉污染現象，基因位點會出現多等位基因，即一個基因位點出現3個或以上峰。考慮到微衛星的不穩定，也不排除細胞突變的情況。

2. 細胞匹配的判讀標準是什么，怎么通過結果大致分析是否存在交叉污染？

答：參考ATCC-ANSI細胞鑒定標準，檢測細胞和已公布的數據比對，匹配度低于0.8則判定細胞和目標細胞系不匹配。匹配度在0.8-1.0之間，判定細胞基本匹配，可能存在交叉污染或者傳代代次過高導致的細胞質量下滑，位點突變的情況。

需注意，當出現3個及以上多等位基因結果時，需進一步參考數據庫排查是否存在 叉污染。匹配度為1.0則樣本和目標細胞匹配，且細胞質量較好。

3. 目前小鼠細胞的STR鑒定是否可以做？

答：目前除部分公布的小鼠細胞位點數據外，還采取自行收錄標準樣本的方式整合小鼠細胞數據庫，市面上常見的小鼠細胞系結果均可進行鑒定。部分少見細胞系，需要通過定向數據比對的方式來確定來源。

4. 什么是 STR？細胞系鑒定原理簡單描述？STR 檢測結果里邊的數字是什么意思？

 答：STR:基因上的短串聯重復序列分子標記（ATATATATATATAT，數字代表段串聯序列重復次數）。每一株構建的細胞系都有一組特異性的 STR 數據與之對應，細胞系是否正確，檢測該樣本的 STR 與數據庫對應的細胞系 STR 比對是否一致即可。一旦細胞系的遺傳特性被確立，細胞系就應該定期的檢測，以防止出現細胞系被誤認或交叉污染的情況。

5. 什么時候需細胞系鑒定？

1、發表文章或申請課題經費前；

2、使用細胞進行臨床治療（試驗）前；

3、準備凍存保種或已凍存多年的細胞；

4、一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時；

5、新得到的細胞或實驗室培養 5 代以上的細胞；

6、細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大；細胞功能不正常；

7，實驗室新建立的細胞系；

6 ，所鑒定的細胞系數據庫沒有 STR 數據參考怎么辦？為什么會無匹配？原代細胞能夠做細胞鑒定嗎?

答：出現匹配不上任何已知數據情況，是因為這株細胞的標準序列并沒有收錄在國際的細胞庫之中，導致送檢樣本與任何的序列都不匹，或者樣本是自主構建的新細胞系。沒有對比數據的，按說也要檢測一下 STR，只要做出來 str 數據跟數據庫排查，如果最后無匹配結果，問題不大，如果跟其他細胞匹配上 比如跟 hela 匹配上就有問題。原代細胞亦可做細胞系 STR 鑒定，一方面將其 STR 與數據庫做個排查。原代細胞鑒定需客戶提供原始組織和原代細胞，成組檢測，以原始組織的 STR 分型結果作為標準數據進行比對。

7. 細胞鑒定已公布的數據來源？

答：DSMZ 數據庫，是整合4個國際數據庫：美國ATCC、德國DSMZ、日本JCRB和RIKEN，Expasy數據庫輔助判斷。

8. 細胞鑒定STR體系涵蓋多少個位點？

答：國際金標準8個STR和1個性別鑒定位點，更額外贈送12個STR位點輔助判斷。

9. 細胞鑒定STR體系是否能應用于干細胞存儲領域？

答：細胞鑒定是一種司法親子鑒定技術，不僅可以鑒定商品化的細胞株，還能應用于干細胞來源性輔助鑒定。入庫細胞和對應干細胞存儲者來源是否一致，也可通過細胞鑒定來實現。

10. 細胞鑒定STR能否分辨轉染細胞株的成功率和挑選轉染細胞株？

答：目前測試下來，轉染和基因改造的細胞系，STR結果基本一致，匹配度大概在0.9-1.0之間，僅通過STR的方法還是沒辦法做篩選穩轉株的目的，建議是通過WB和基金測序，單克隆挑選來篩選想要的穩轉細胞株。